Новые полиморфизмы гена CNTN3, ассоциированные с показателями мясной продуктивности у овец породы манычский меринос
DOI:
https://doi.org/10.31279/2949-4796-2025-15-4-24-33Ключевые слова:
гены-кандидаты, CNTN3, мясная продуктивность, манычский меринос, овцы, SNPАннотация
Введение. Метод маркер-ассоциированной селекции основан на ускоренном отборе сельскохозяйственных животных по ДНК-маркерам ценных признаков. По результатам полногеномного ассоциативного исследования частоты встречаемости отдельных однонуклеотидных полиморфизмов с использованием ДНК-биочипов были идентифицированы гены-кандидаты, в число которых входил ген CNTN3. Прямые экспериментальные данные об экспрессии гена CNTN3 у мериносовых пород овец в настоящее время отсутствуют. Таким образом, существует пробел в знаниях о структурных вариантах гена CNTN3 и их связи с продуктивными качествами.
Цель. Изучение структуры гена CNTN3 у овец породы манычский меринос и обнаружение в нем полиморфизмов, ассоциированных с показателями мясной продуктивности для их дальнейшего применения в маркер-опосредованной селекции.
Материалы и методы. Материалом для исследования послужила геномная ДНК из образцов крови баранов породы манычский меринос. Секвенирование проводили с использованием геномного секвенатора NovaSeq 6000 (Illumina, Inc., США). Сборку генома проводили с помощью ARS-UI_Ramb_v2.0 NCBI (National Center for Biotechnology Information). Для описания обнаруженных однонуклеотидных замен использовалась номенклатура HGVS (Human Genome Variation Society).
Результаты. В результате секвенирования гена CNTN3 было обнаружено 7232 полиморфизма. Из их числа выявлены группы полиморфизмов (27297434, 27297454, 27297488), демонстрирующих максимальную статистическую значимость ассоциаций с признаками мясной продуктивности у овец. Обнаружены новые структурные варианты (дупликация в позиции 27337036 и однонуклеотидные замены в локусах 27097370 и 27418238).
Заключение. Полученные результаты исследования структуры гена CNTN3 показывают его связь с живой массой, а выявленные полиморфизмы могут быть использованы как молекулярные маркеры для селекции овец мериносового направления.
Для цитирования: Баранова Д.Е., Криворучко А.Ю., Яцык О.А., Лиховид Н.Г. Новые полиморфизмы гена CNTN3, ассоциированные с показателями мясной продуктивности у овец породы манычский меринос. Аграрный вестник Северного Кавказа. 2025;15(4):24-33. https://doi.org/10.31279/2949-4796-2025-15-4-24-33 EDN NWKNUC
To cite: Baranova D.E., Krivoruchko A.Yu., Yatsyk O.A., Likhovid N.G. New CNTN3 gene polymorphisms associated with meat productivity indicators in Manychsky Merino sheep. Agrarian Bulletin of the North Caucasus. 2025;15(4):24-33. (In Russ.) https://doi.org/10.31279/2949-4796-2025-15-4-24-33
Библиографические ссылки
Zinovieva N.A., Kostyunina O.V., Gladyr E.A., et al. The role of DNA markers of productivity characteristics in farm animals. Zootechnics. 2013;9:5-7. (In Russ.).
Zhang L., Liu J., Zhao F., et al. Genome-wide association studies for growth and meat production traits in sheep. PLoS ONE. 2013;8(6):e66569. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0066569
Han Y., Akhtar M.F., Chen W., et al. Potential candidate genes influencing meat production phenotypic traits in sheep: a review. Frontiers in Veterinary Science. 2025;12:1616533. https://doi.org/10.3389/fvets.2025.1616533
Krivoruchko A., Sermyagin A., Saprikina T. et al. Genome wide associations study of single nucleotide polymorphisms with productivity parameters in Jalgin merino for identification of new candidate genes. Gene Reports. 2021;23:101065. https://doi.org/10.1134/S1022795423050095
Dyer S.C., Austine-Orimoloye O., Azov A.G., et al. Ensembl 2025. Nucleic Acids Research. 2025;53(D1):D948-D957. https://doi.org/10.1093/nar/gkae1071
Zhu Y.F., Guo Y.B., Zhang H.Y., et al. Prognostic significance of contactin 3 expression and associated genes in glioblastoma multiforme. Oncology Letters. 2019;18(2):1863-1871. https://doi.org/10.3892/ol.2019.10482
Nikolaienko R.M., Hammel M., Dubreuil V., et al. Structural basis for interactions between contactin family members and protein-tyrosine phosphatase receptor type G in neural tissues. Journal of Biological Chemistry. 2016;291(41):21335-21349. https://doi.org/10.1074/jbc.M116.742163
Kilgour A.H., Todd O.M., Starr J.M. A systematic review of the evidence that brain structure is related to muscle structure and their relationship to brain and muscle function in humans over the lifecourse. BMC Geriatrics. 2014;14(85). https://doi.org/10.1186/1471-2318-14-85
Yeo G.W.M. Splicing regulators: targets and drugs. Genome Biology. 2025;6(240). https://doi.org/10.1186/gb-2005-6-12-240
Dwyer K., Agarwal N., Pile L. et al. Gene Architecture Facilitates Intron-Mediated Enhancement of Transcription. Molecular Biosciences. 2021;8:669004. https://doi.org/10.3389/fmolb.2021.669004
Boni C., Sorio C. The role of the tumor suppressor gene Protein Tyrosine Phosphatase Gamma (PTPRG) in cancer. Frontiers in Cell and Developmental Biology. 2022;9. https://doi.org/10.3389/fcell.2021.768969
Benavides M., Souza C., Moraes J. How efficiently Genome-Wide Association Studies (GWAS) identify prolificity-determining genes in sheep. Genetics and Molecular Research. 2018;17(2):gmr16039909. https://doi.org/10.4238/gmr16039909
VanRaden P.M., Sullivan P.G. International genomic evaluation methods for dairy cattle. Genetics Selection Evolution. 2010;42(7). https://doi.org/10.1186/1297-9686-42-7
Trukhachev V.I., Selionova M.I., Krivoruchko A.Yu., et al. Genetic markers of meat productivity of sheep (Ovis aries L.). I. Myostatin, Calpain, Calpastatin. Agricultural Biology. 2018;53(6):1107-1119. (In Russ.) https://doi.org/10.15389/agrobiology.2018.6.1107rus
Gallegos J.E., Rose A.B. Intron DNA sequences can be more important than the proximal promoter in determining the site of transcript initiation. Plant Cell. 2017;4:843–853. https://doi.org/10.1105/tpc.17.00020
Prihandini P.W., Hariyono D.N., Tribudi Y.A. Myostatin gene as a genetic marker for growth and carcass traits in beef cattle. Indonesian Bulletin of Animal and Veterinary Sciences. 2021;31(1):37–42. https://doi.org/10.14334/wartazoa.v31i1.2530
Zuev R.V., Krivoruchko A.Yu., Kukharuk M.Yu., Nikitina A.V. Search for candidate genes associated with live weight in north Caucasian meat and wool sheep. Bulletin of NSAU (Novosibirsk State Agrarian University). 2023;(1):123-129. (In Russ.) https://doi.org/10.31677/2072-6724-2023-66-1-123-129
Kunin E. V. The origin of introns and their role in eukaryogenesis: a compromise solution to the debate on whether introns appeared early or late. Biology Direct. 2006;2006;1(22). https://doi.org/10.1186/1745-6150-1-22
Загрузки
Как цитировать
Выпуск
Раздел
Лицензия
Copyright (c) 2025 Д.Е. Баранова, А.Ю. Криворучко, О.А. Яцык, Н.Г. Лиховид
Это произведение доступно по лицензии Creative Commons «Attribution» («Атрибуция») 4.0 Всемирная.
